第40回バスケットボール日本リーグは、2006年から2007年まで、日本各地で行われたバスケットボールリーグである。バスケットボール日本リーグ機構（旧JBL）が2007年より日本バスケットボールリーグに移行するため、旧JBL主催として最後の日本リーグとなる。同年より日本バスケットボールリーグ2部機構（JBL2）に移行される。
参加チーム 日立電線ブルドッグス 大塚商会アルファーズ 千葉ピアスアローバジャーズ 黒田電気ブリット・スピリッツ（新規参加） 東京海上日動ビッグブルー 石川ブルースパークス 豊田合成スコーピオンズ（新規参加） 豊田通商ファイティングイーグルス 大塚商会はこのシーズンを最後に休部し、栃木ブレックスにJBL2会員資格を譲渡した。
結果 レギュラーシーズン順位 順位チーム名成績勝率1千葉ピアスアローバジャーズ11勝3敗.7862豊田通商ファイティングイーグルス10勝4敗.7143日立電線ブルドッグス9勝5敗.6434大塚商会アルファーズ7勝7敗.5005豊田合成スコーピオンズ6勝8敗.4296黒田電気ブリット・スピリッツ5勝9敗.3577石川ブルースパークス5勝9敗.3578東京海上日動ビッグブルー3勝11敗.214
最終順位 順位チーム名1千葉ピアスアローバジャーズ2豊田通商ファイティングイーグルス3日立電線ブルドッグス4大塚商会アルファーズ5豊田合成スコーピオンズ6黒田電気ブリット・スピリッツ7石川ブルースパークス8東京海上日動ビッグブルー
JBLアウォード 部門受賞者チームMVP岡村憲司千葉ルーキー・オブ・ザ・イヤー山田謙治大塚商会コーチ・オブ・ザ・イヤー岡村憲司千葉
ベスト5 P受賞者チーム G 宮崎恭行 豊田通商 G/F 高村和臣 日立電線 F 高岡大輔 大塚商会 F/C 岡村憲司 千葉 C ブライアン・マッキー 豊田通商
関連項目 バスケットボール日本リーグ JBLスーパーリーグ 2006-07 第82回天皇杯・第73回皇后杯 全日本総合バスケットボール選手権大会