台湾総督府軍務局（たいわんそうとくふぐんむきょく）は、台湾総督に委任された兵権に基づき、台湾総督府に置かれた管轄区域内における陸海軍の軍政及び軍令を所掌する機関である。設置期間は1896年4月から1897年10月までであるが、この項目では、総督府設置から1919年8月に総督への軍事権委任の解除まで置かれた軍政軍令所掌機関を含めて記述する。
概要 1895年（明治28年）5月に台湾総督府が設置された。台湾総督は管轄区域内の陸海軍を統率する権限が与えられ、総督府に陸軍局、海軍局を設置し、それぞれに長官と幕僚をおいた台湾総督府仮条例（明治28年5月21日）。
同年8月6日、台湾総督府条例（明治28年陸達第70号）が施行され、次のように総督幕僚、陸軍局、海軍局を置いた。
総督幕僚 参謀部 副官部 - 第一課（文書関係） 第二課（人事関係） 第三課（用度関係） 陸軍局 - 砲兵部 工兵部 憲兵部 監督部 軍医部 法官部 電信部 郵便部 海軍局
1896年（明治29年）4月1日、新に軍務局が設置された台湾総督府条例（明治29年3月31日勅令第88号）。その組織は次のように定められた台湾総督府軍務局官制（明治29年4月1日勅令第116号）。
軍務局 局長 副官 陸軍部 第一課 第二課 第三課 第四課 海軍部 第一課 第二課
1897年（明治30年）11月1日、軍務局が廃止され、新に陸軍幕僚、海軍幕僚が設置された台湾総督府官制（明治30年10月21日勅令第362号）。以下、陸軍と海軍を分けて記述する。
陸軍 1897年11月に設置された陸軍幕僚の組織は次のように定められた台湾総督府陸軍幕僚条例（明治30年10月21日勅令第363号）。 陸軍幕僚 参謀長 参謀部 副官部
1907年（明治40年）10月14日、陸軍幕僚を廃止し陸軍部を設置した台湾総督府陸軍部条例（明治41年１月29日軍令陸第4号）。その組織は次のとおり定められ、1919年（大正8年）8月20日に廃止大正8年8月20日軍令陸第21号されるまで存続した。1919年3月7日、陸軍兵器部が台北庁大加蚋堡三板橋庄東門外72番地に移転した『官報』第1985号、大正8年3月18日。。
陸軍部 参謀長 （幕僚）参謀部 副官部 法官部 経理部 軍医部 獣医部
海軍 1897年11月に設置された海軍幕僚の組織は次のように定められた台湾総督府海軍幕僚条例（明治30年10月21日勅令第364号）。
海軍幕僚 参謀長 参謀（出師準備・作戦計画担当） 副官（人事・庶務担当） 機関長 軍医長 主計長
1901年（明治34年）7月4日、組織が縮小され、参謀長、参謀（事務担当）、副官、主計長が置かれた台湾総督府海軍幕僚条例中改正ノ件（明治34年7月3日勅令第142号）。さらに、1903年（明治36年）11月6日、主計長を廃止し、参謀長、参謀（事務担当）、副官を置き、1919年8月20日に廃止大正8年8月20日勅令第395号されるまで存続した。
1919年（大正8年）8月20日に台湾総督への軍事権の委任が廃止され台湾総督府官制中改正ノ件（大正8年6月28日勅令第311号）、それに伴い陸軍部、海軍幕僚も廃止された。陸軍部は台湾軍に改編され、総督は台湾軍司令官に兵力の使用を請求できるものとされた。
歴代参謀長等 総督府参謀長 大島久直 陸軍少将：1895年5月23日 - 1895年8月8日 総督参謀長 大島久直 陸軍少将：1895年8月8日 - 1896年4月1日 軍務局長 立見尚文 陸軍少将：1896年4月1日 - 1897年11月1日 陸軍 陸軍局長官 （兼）大島久直 少将：1895年5月23日 - 1895年8月6日 陸軍局長 （兼）大島久直 少将：1895年8月6日 - 1896年4月1日 軍務局陸軍部長 （兼）立見尚文 少将：1896年4月1日 - 1897年11月1日 陸軍幕僚参謀長 立見尚文 少将：1897年11月1日 - 1898年10月1日 木越安綱 少将：1898年10月1日 - 1900年4月25日 中村覚 少将：1900年4月25日 - 1902年3月10日 武田秀山 少将：1902年3月10日 - 1902年12月24日死去 谷田文衛 少将：1903年1月13日 - 1907年2月4日 宮本照明 少将：1907年2月4日 - 1907年10月14日 陸軍部参謀長 宮本照明 少将：1907年10月14日 - 1912年8月3日 足立愛蔵 少将：1912年8月3日 - 1913年7月3日 木下宇三郎 少将：1913年7月3日 - 1916年1月21日 有田恕 少将：1916年1月21日 - 1917年8月6日 山田陸槌 少将：1917年8月6日 - 1918年8月19日 東乙彦 少将：1918年8月19日 - 1918年8月19日 曽田孝一郎 少将：1918年11月18日 - 1919年8月20日
海軍 海軍局長官 田中綱常 予備役少将：1895年5月21日 - 海軍局長 角田秀松 少将：1895年8月15日 - 1896年4月1日 軍務局海軍部長 角田秀松 少将：1896年4月1日 - 1897年11月1日 海軍参謀長 角田秀松 少将：1897年11月1日 - 1897年12月27日 黒岡帯刀 少将：1897年12月27日 - 1901年7月4日 成川揆 大佐：1901年7月4日 - 1903年7月7日 山縣文蔵 中佐：1903年7月7日 - 1905年3月15日 山本正勝 中佐：1905年3月15日 - 1905年6月14日 宮地貞辰 大佐：1905年6月14日 - 1906年8月30日 羽喰政次郎 大佐：1906年8月30日 - 1907年11月15日 土山哲三 大佐：1907年11月15日 - 1909年12月1日 西山実親 大佐：1909年12月1日 - 1910年9月28日 東郷吉太郎 大佐：1910年9月28日 - 1912年6月18日 秀島成忠 大佐：1912年6月18日 - 1914年5月29日 田所広海 大佐：1914年5月29日 - 1914年12月1日 秋沢芳馬 大佐：1914年12月1日 - 1916年12月1日 増田幸一 大佐：1916年12月1日 - 1918年5月3日 増田高頼 大佐：1918年5月3日 - 1919年8月20日
脚注
参考文献 秦郁彦編『日本陸海軍総合事典』第2版、東京大学出版会、2005年。 外山操・森松俊夫編著『帝国陸軍編制総覧』芙蓉書房出版、1987年。 外山操編『陸海軍将官人事総覧 陸軍篇』芙蓉書房出版、1981年。 海軍歴史保存会編『日本海軍史』第9・10巻、発売:第一法規出版、1995年。