専門外来（せんもんがいらい）とは、ある疾患または症状に対して、専門的な診察・治療を行う専門の外来科を指す。また、診療科よりも更に細分化されたものを指すこともある。
多くの病院・医院の場合、「内科の○○専門外来」と言うように診療科に附属して開設されており、担当医も専門医・指導医レベルの医師・歯科医師が就くことが一般的である。ただし専門外来では治療対象が多岐にわたることもあり、特に総合病院では他科の医師と提携して治療を行う場合もある。
なお、現在のところ専門外来の表記についての規制法規は存在しない。
主な専門外来 内科 リウマチ専門外来 膠原病専門外来 神経内科専門外来 内分泌専門外来 胃腸専門外来 性感染症専門外来
呼吸器科 花粉症専門外来 スリープクリニック 睡眠時無呼吸専門外来 イビキ専門外来
外科・形成外科 乳腺専門外来 肛門専門外来 腫瘍専門外来 熱傷（やけど）専門外来
小児科 成長・発達専門外来 小児生活習慣病専門外来 児童精神科専門外来
皮膚科 アトピー専門外来 角化症専門外来
眼科 ドライアイ専門外来 光凝固専門外来
循環器科 ペースメーカー専門外来
耳鼻咽喉科 喉頭専門外来 めまい専門外来 補聴器専門外来
歯科 口腔インプラント専門外来 顎関節症・口腔顔面痛み専門外来 審美歯科専門外来 特殊義歯専門外来 口臭専門外来 口内炎専門外来 口唇口蓋裂専門外来 歯科金属アレルギー専門外来
精神科・心療内科 ものわすれ外来 摂食障害専門外来 発達障害専門外来 依存症専門外来 禁煙外来など ジェンダー・アイデンティティ・クリニック クレプトマニア専門外来 性的倒錯専門外来
産婦人科 女性専門外来…女性特有の疾患を広く取り扱う専門外来が多く、医師や看護師などスタッフ全員が女性である所もある。 不妊専門外来 更年期障害専門外来 PMS外来 生殖内分泌専門外来 不育症専門外来
麻酔科 ペインクリニック（三叉神経痛・帯状疱疹後神経痛・外傷後神経痛・バージャー病・癌性疼痛・多汗症）
薬剤関係 漢方専門外来
スポーツ医学関係 スポーツ・関節専門外来 スポーツ歯科専門外来
関連項目 病院／医院（歯科医院） 病気／感染症／伝染病 医師／歯科医師／薬剤師／看護師／歯科衛生士／臨床検査技師 専門医／認定医