Michael J. Flynn (Nova Iorque, ) é um cientista da computação dos Estados Unidos, professor emérito da Universidade de Stanford. Graduou-se em engenharia em 1955 pela Manhattan College e concluiu o mestrado cinco anos mais tarde, pela Universidade de Syracuse. Em 1961 concluiu o doutorado pela Universidade de Purdue. Propôs a taxonomia de Flynn em 1966, uma forma de classificação de arquiteturas de computador de acordo com instrução e fluxo de dado.
Em 1995 recebeu o Prêmio Memorial Harry H. Goode.
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