SMC3 или белок структурной поддержки хромосом номер три () — белок, который у человека кодируется геном SMC4.
Длина полипептидной цепи белка составляет 1217 аминокислотных остатков, а молекулярная масса — 141542 Да.
Структура и взаимодействия
Доменная организация SMC-белков эволюционно консервативна и состоит из N-концевого мотива Walker A, катушки (двуспиральная область), "петли", катушки и С-концевого мотива Walker B. Белок складывается сам на себя, образуя стержнеобразную молекулу с гетеродимеризационным "петлевым" доменом на одном конце и АТФазной "головкой" ABC-типа на другом. Эти глобулярные домены разделены антипараллельной спиралью длиной ~ 50 нм. SMC3 и SMC1 связываются через свои шарнирные домены, образуя V-образные гетеродимеры. N-концевой домен RAD21 связывается со спиралью SMC3 чуть выше головного домена, а C-концевой домен RAD21 связывается с головным доменом SMC1. В результате такого связывания тримера SMC3-SMC1-RAD21 образуется замкнутое кольцо, внутри которого может быть захвачена ДНК.
Когда происходит репликация ДНК и устанавливается сцепление сестринских хроматид, SMC3 ацетилируется по паре высококонсервативных лизинов под действием ESCO1 и ESCO2. У почкующихся дрожжей этой модификации достаточно для стабилизации когезина на ДНК до митоза, но у животных также требуется связывание сорорина.
Во время мейоза SMC3 образует когезиновые комплексы с SMC1ß, STAG3 и REC8, которые создают когезию между гомологичными хромосомами и сестринскими хроматидами.
Функции Этот ген принадлежит к SMC3 подсемейству SMC-белков. Белок, кодируемый этим геном, может присутствовать в определённых типах клеток как внутриклеточный, ядерный или даже секретируемый белок. Ядерная форма, известная как белок структурной поддержки хромосом 3, является компонентом когезина, мультибелкового комплекса, который скрепляет сестринские хроматиды в процессе митоза, обеспечивая надлежащую сегрегацию хромосом. По окончании синтеза этот белок может подвергаться посттрансляционной модификации — добавлению цепи хондроитин сульфата. В результате образуется секретируемый протеогликан бамакан, который в больших количествах содержится в базальной мембране.
Синдром Корнелии де Ланге Синдром Корнелии де Ланге (CdLS) — редкое генетическое заболевание, которое проявляется различными клиническими аномалиями, включая дисморфические черты, тяжёлую задержку роста, глобальную задержку развития и умственную отсталость. SMC3 —— один из пяти генов, которые были связаны с CdLS. В одном из сообщений о случае была обнаружена новая дупликация гена SMC3 у ребёнка с задержкой роста, гипотонией и дисморфическими чертами лица при синдроме Корнелии де Ланге. Такая же дупликация была обнаружена и у матери, у которой дисморфические черты лица были более мягкими.
Модельные организмы +Фенотип мышей с нокдауном по Smc3 Характеристика ФенотипЖизнеспособность гомозиготненормальный Летальность для гомозиготненормальный Фертильность гомозиготненормальный Вес теланенормальный БеспокойностьНорма НеврологияНорма Сила хваткиНорма Горячая тарелочкаНорма ТератологияненормальныйНепрямая калориметрияНорма Глюкозотолерантный тестНормаСлуховой ответ ствола мозгаНорма DEXAненормальный РентгенографияНорма Температура телаНорма Морфология глазаНорма Клиническая химияНорма ГематологияНормаПериферические лимфоцитыНорма Масса сердцаНорма Гистопатологии глазаНормаИнфицирование SalmonellaНормаИнфицирование Citrobacter Норма Информация взята изMouse Resources Portal , Wellcome Trust Sanger Institute. В исследовании функции гена SMC3 были использованы нокаутные мыши линии Smc3tm1a(EUCOMM)Wtsi. Линия была создана в рамках Международного консорциума нокаут мыши программа — с высокой пропускной способностью анализа мутантов животных, представляющих модели заболеваний, которые интересуют учёных.
Особей мужского и женского пола прошли стандартизированный фенотипические тесты, чтобы определить последствия делеции гена. Двадцать два испытания проводили на мутантных мышей и было обнаружено шесть существенных отклонений. Гомозиготы по этой мутации погибали ещё нас ранних стадиях эмбриогенеза. Все тесты проводились на гетерозиготных взрослых мышах. У самок наблюдалась повышенная смертность в потомстве до перехода к самостоятельному питанию, а также снижение массы тела. Самцы гетерозигот имели укороченную, вздернутую морду.
См. также Синдром Корнелии де Ланге
Примечания
Ссылки GeneReviews/NCBI/МКВТ/низ вход на Корнелии де Ланге синдром FactorBook SMC3
Категория:Белки человека