Вирус гепатита C подразделяется на 8 генотипов, а те, в свою очередь, на свыше 100 подтипов. Генотипы вируса гепатита С различаются между собой по вариабельности нуклеотидного уровня более чем на 30%; подтипы внутри генотипа вируса вариабельны между собой примерно на 15%.
Все генотипы вируса способны приводить к циррозу и гепатоцеллюлярной карциноме, однако генотип 3 является фактором более быстрого прогрессирования заболевания.
Географически наиболее распространены генотипы 1—4. В Северной Америке и Западной Европе наиболее распространён подтип 1a, охватывающий до 70% всех случаев. В Центральной и Восточной Европе наиболее распространён подтип 1b. На просторах бывшего СССР наибольшее распространение получили подтип 1b и генотип 3. Генотип 4 наиболее распространён на Ближнем Востоке и Африке: в Египте на него приходится до 90% всех инфекций.
Наиболее сложны в лечении подтип 1a и генотип 3. Из-за большого генетического разнообразия генотипа 2, часто вступающего в рекомбинанты с другими генотипами, встречаются отдельные штаммы генотипа 2, более устойчивые к терапии.
Самым проработанным для лечения является подтип 1b.
Согласно проведённому эволюционному анализу, ближайший общий предок вируса генотипа 3a существовал приблизительно 200 лет назад.Akkarathamrongsin S, Hacharoen P, Tangkijvanich P, et al. Molecular epidemiology and genetic history of hepatitis C virus subtype 3a infection in Thailand. Intervirology 2013; 56: 284–94.
+ Географическое распределение подтипов вируса гепатита C Генотипы Подмножества Географическое распределение Генотип 1 1a, 1b... 1n — всего 13 поименованных и 7 безымянных подтипов Северная Америка, Евразия, Центральная Африка Генотип 2 2a, 2b... 2u — всего 15 поименованных и 8 безымянных подтипов Западная Африка, Италия Генотип 3 3a, 3b... 3k — всего 8 поименованных подтипов и 1 безымянный Индостан, Юго-Восточная Азия, республики бывшего СССР Генотип 4 4a, 4b... 4w — всего 18 поименованных и 10 безымянных подтипов Центральная Африка, Египет Генотип 5 5a Южная Африка и Азия Генотип 6 6a, 6b... 6xf — всего 29 поименованных подтипов и 21 безымянный Юго-Восточная АзияГенотип 7Демократическая республика КонгоГенотип 8Штат Пенджаб (Индия)Рекомбинантные генотипы1a/1c, 1b/1a, 2/5, 2b/1a, 2b/6w, 2k/1b, 4d/4a, 6n/6o и прочие
Методы определения Основные методы, используемые для диагностики генотипа HCV, являются следующие: Иммуноферментный анализ Полимеразная цепная реакция в реальном времени Рекомбинантный иммуноблот анализ
Ссылки
Категория:Гепатит C