«Евангелион: 3.0+1.01: Как-то раз»; — анимационный фильм режиссёра Хидэаки Анно, выпущенный Studio Khara. Это четвёртый фильм в тетралогии Rebuild of Evangelion, основанный на сериале «Евангелион». Изначально выход намечался на 2015 год, но работа была приостановлена в связи с участием Анно в создании киноленты «Годзилла: Возрождение». Производство возобновилось в конце 2016 года. Премьера была запланирована на 27 июня 2020 года, но отложена из-за пандемии COVID-19. Новая дата установлена на 23 января 2021 года. Ввиду опасной эпидемиологической обстановки в Японии 14 января 2021 года объявлен перенос. Премьера состоялась 8 марта 2021 года. В программе Professional: The Way of Work, вышедшей на канале NHK 22 марта 2021 года, режиссёр заявил, что «с этим я закончил с Евой» и у него больше нет эмоциональной привязанности. Премьера за пределами Японии планировалась 13 августа 2021 года на потоковом сервисе Amazon Prime Video, но случилась на день раньше.
Сюжет Wille размещает свою базу в Париже, где хранятся боеприпасы и запчасти Евангелионов, и под руководством Рицуко Акаги готовится к восстановлению города. Их атакуют с воздуха Евы 44А, посланные Nerv. Мари на Еве-08 защищает преобразователь среды, пока команда работает над устройством. Однако главные силы противника — это запрещённые Ватиканским договором энергоблоки 44Б и позитронная пушка 4444С, способная одним выстрелом разбить оборону из летающих кораблей. При помощи разрушенной Эйфелевой башни Мари уничтожает орудие. Теперь город в безопасности, туда заходят Wunder и его флот. Тем временем Аска, Рей и подавленный Синдзи идут по опустошённой красной пустыне, где местами нарушена гравитация. Однако их обнаруживает выживший Кэнсукэ Аида и доставляет в Деревню-3, которая находится на попечении Wille. Первоначально Синдзи и Рей селятся у Тодзи Судзухары, который теперь женат на Хикари Хораки и успел обзавестить дочерью Цубамэ. Вскоре, однако, Синдзи вызывает раздражение у родственников Тодзи тем, что упорно отказывается есть достаточно богатое по меркам деревни угощение. В результате его забирает к себе Кэнскэ, у которого по неким не озвученным причинам уже проживает Аска. Привычка Аски ходить по дому Кэнскэ полуголой не вызывает никакой реакции у Синдзи, но как только видит у неё такой же ошейник, от которого Каору лишился головы, его рвёт. Аска из-за своей сущности не должна появляться в деревне, не может уснуть и называет людей Лилин. Рей остаётся у семьи Судзухары и работает на рисовом поле, выполняя дневную норму. Принимая тёплую ванну, а не LCL, она задаётся вопросом: как это — жить без приказа? Аска вне себя от злости и заталкивает апатичному Синдзи еду в рот, обвиняя его в том, что он творит зло и поэтому больше ничего не хочет делать. Синдзи уходит к развалинам бывшего отделения Nerv на берегу озера.
Аска говорит с куколкой, что всегда будет одна. Рей ищет Синдзи, Аска объясняет ей, что как средство сдерживания пилотов, они были созданы с неполноценными эмоциями. Конкретно же серию Аянами так запрограммировали в Nerv, чтобы им нравился третий мальчик. Когда Рей находит Синдзи, то начинает регулярно навещать его принося ему пайки и постепенно выводит из депрессии.
Рей помогает по хозяйству, Синдзи долго молчит. Однажды Аянами спрашивает, защищает ли Синдзи деревню, получив ответ, что он всё разрушил, никого не хочет видеть и не понимает доброго к себе отношения. Когда Икари приходит в себя, Кэнсукэ берёт его своим помощником. Wille устанавливают сдерживающее поле, за которым находится красная зона и пришедшие в движение безголовые Евы. Если они прорвутся — деревне конец.
Рей просит Синдзи, чтобы он дал ей имя в новой жизни. Через некоторое время Аянами становится плохо — она может существовать только в пределах штаба Nerv, а уровень LCL падает. Тодзи идёт вместе с Синдзи и вспоминает прошлое. Кэнсукэ говорит, что его отец погиб от несчастного случая. Так как Гэндо Икари жив, то Синдзи нужно встретиться с ним.
Рей переодевают в школьную форму. На участке по восстановлению Кэнсукэ знакомит Синдзи с 14-летним Рёдзи-младшим, сыном Кадзи и Мисато. Отец Рёдзи умер, пытаясь остановить Третий удар, а мать ушла, считая себя недостойной. Скоро прибывает Wunder с поставками. Рей осознаёт, что осталось недолго и плачет. Она оставляет Хикари записку, где благодарит за всё и прощается. Синдзи произносит, что не хочет думать о другом имени, кроме Аянами. Рей отвечает, что счастлива и вновь передаёт плеер. Она не может здесь выжить и превращается в LCL.
Синдзи решает пойти с Аской на Wunder и получает пулю со снотворным. Просыпаясь, он видит Сакуру, сестру Тодзи, которая бьёт его по лицу за пилотирование Евы. Икари (объект «БМ-03») помещают в особую камеру. Личный состав от этого не в восторге. Аску повышают до майора. Мари наполняет их комнату книгами. Аска говорит, что сопляку Синдзи нужна не девушка, а мать. Wunder — это ковчег, сохраняющий жизнь на Земле, корабль Кадзи доверил Мисато. Новая штаб-квартира Nerv с Чёрной луной движутся к Южному полюсу, эпицентру Второго удара, чтобы завершить план Seele реактивацией Евы-13. Кодзо Фуюцуки по приказу Гэндо готовит к запуску Евы 09-12 для окончания Четвёртого удара и завершения проекта комплементации человечества. Старик знает, что Икари заставил сына испытать боль от потери, когда Аянами № 6 утратила форму. Рицуко говорит Мисато, что та пожалеет за мягкость к Синдзи, и не следовало пускать его на борт. Кацураги смотрит на фотографию Синдзи и сына.
Nerv прибывает в пункт назначения; до конца света остаётся несколько часов. Флот Wunder и две Евы приводятся в боевую готовность. Аске и Мари выдают новые защитные белые костюмы. Аска в последний раз спрашивает Синдзи, понял ли он, за что она хотела его ударить. Ответ был правильным: потому что он не смог взять на себя ответственность, не решив ни помочь, ни убить её в тестовой Еве, заражённой Ангелом. Аска понимает, что Синдзи вырос и признаётся, что раньше любила его, но повзрослела быстрее. Мари прощается по-китайски: «Цзай цзянь!» («До свидания!»). Видение Каору говорит Синдзи, что он должен найти собственное место и они обязательно встретятся.
Wunder начинает операцию «Ямато» по предотвращению Четвёртого удара и нейтрализации Евы-13. Правый борт атакован аналогичным по мощности кораблём Nerv под командованием Фуюцуки. Wunder включает аварийное погружение, сталкивается с роем Евангелионов и попадает в засаду. Пока флагман прорывается к Чёрной луне, Аска и Мари прикрывают от натиска бесчисленных Ев-07. Аска добирается до Евы-13, но не может проникнуть через AT-поле и разбить ядро. Мари получает ранение. Корабли Nerv спускаются в эпицентр — врата в ад и создают «крылья света», чтобы открыть двери Гафа. В этот момент необнаруженный четвёртый корабль протаранил Wunder. Аска использует последнее средство Евы-02: активирует чёрный код 999, снимает повязку и выпускает из себя девятого Ангела, перестав быть человеком. Однако это не помогает, Ева-13 запускается, разрывая и сжигая Аску. К ней является «оригинал», которая говорит, что клон серии Сикинами должен воссоединиться с ней. Ева-02 взрывается в LCL. К Wunder прицепляется паразит — Ева-09, блокирующая систему управления. Все корабли искусственно создают Лилит и превращают Чёрную луну в спиральное копье. Мари отступает из рушащегося штаба Nerv. Гэндо Икари появляется на палубе флагмана, подготовив Еву-13 к пробуждению. Рицуко стреляет в него, но безрезультатно, поскольку он использовал ключ Навуходоносора, чтобы стать богом. Гэндо раскрывает сценарий Seele: пилоты Аянами и Сикинами были специально созданы для завершения проекта, а Второй удар, вызванный доктором Кацураги, был первым этапом плана. Ева-13 съедает девятого Ангела и завершает Четвёртый удар, открыв двери Гафа с помощью копья Чёрной луны. Все человеческие души сливаются с цельноядерными Евами, в последнем ритуале их коллективный разум попадёт в рай. Гэндо объясняет, что Ангелы вкусили плод Древа Жизни, но теперь люди их победили и должны наслаждаться вечностью как дети божьи, так как «всадники» (Евы 09—12) уже собрались. Икари требует вернуть Еву-01 и заходит в тринадцатую. Земля поглощается Евами бесконечности, Деревня-3 едва держится, за дверьми Гафа — антивселенная, куда Wunder не пройдёт. Wille больше не в состоянии сражаться. Синдзи предлагает пустить его в оставшуюся Еву.
Мари бьётся с Евой-паразитом. Синдзи говорит Мисато, что хочет разобраться с отцом сам и надевает ошейник. Сакура Судзухара и Мидори Китаками пытаются убить парня за устроенный им ад, но пулю принимает Мисато, которая поручилась за него. Теперь другого выбора нет, кроме как поддержать командира. Мари на Еве-08 забирает Синдзи в родном сине-белом контактном костюме, чтобы он попал в антивселенную, где находится Гэндо. Внутри Евы-01 оригинальный клон Аянами извиняется за прошлое, но Синдзи отвечает, что всё в порядке. Синхронизация Синдзи достигает бесконечного показателя. Обе Евы с копьями Кассия и Лонгина попадают в Голгофу, основу мироздания, где была Юи Икари. Именно там судьба подчиняется воле одного человека. LCL создаёт симуляцию воспоминаний. Сын сопротивляется и выступает против отца. Битва происходит в виртуальном Токио-3, квартирах Мисато и Рей, школе, а также в Геофронте, на поле арбузов Кадзи, развалинах Nerv. Первая Ева воплощает надежду, тринадцатая — отчаяние. Синдзи, вспоминая Деревню-3, понимает, что проигрывает и силой Гэндо не победить. Решив договориться, сын узнаёт, что с помощью двух копий на Голгофе отец намерен инициировать собственный Удар.
Мисато собирается создать из позвоночника Wunder новое копьё и отправить Синдзи. Гэндо показывает сыну «чёрную Лилит» — воображаемый Евангелион, его существование предсказывал доктор Кацураги, отец Мисато. Копья дополняют друг друга, реальность и фантазия смешиваются, всё становится целым. Последний ритуал начинается и Дополнительный удар Гэндо переписывает мир заново как способ исполнения желаний. Очеловеченная Лилит поднимается из дверей Гафа и подчиняет все Евы бесконечности. Мари приходит к Фуюцуки, он замечает, что вместе с Икари они слишком долго цеплялись за надежду. Старик заявляет, что его работа закончена и Мария Искариот может поступать как хочет. Фуюцуки обращается к Юи и распадается в LCL. Мисато приказывает оставшейся команде покинуть флагман и готовится атаковать гигантскую Лилит. Мари уничтожает последние Евы и корабли Nerv. Гэндо показывает Синдзи мир, в котором нет А.Т.-полей и любых барьеров, а человечество имеет одно сердце и разум, чистые и незапятнанные. Сын в ответ передаёт отцу знакомый плеер, который был у него раньше. Они оказались похожи в детстве. Гэндо жил нелюдимым до встречи с Юи (их познакомила Мари), а потеряв её, не смог смириться с одиночеством, не желая признавать свою слабость, поэтому создал Рей и задумал комплементацию. Мисато на Wunder прорывается через руки Лилит. Мари бросает копьё Гая (знание и сила воли), которое попадает прямо в глаз сущности. У Синдзи появляется оружие, способное остановить удар. Однако флагман взрывается вместе с Мисато. Гэндо признаётся, что считал сына наказанием и отстранился от него, думая, что так будет лучше. Открывшись Синдзи, отец понимает, что жена была рядом, даже после смерти, и получает искупление. Появляется Каору и спрашивает Синдзи, чего тот хочет. Сейчас для него важны не собственные переживания, а спасение Аски и друзей. Каору исполняет желание.