Преследование свидетелей Иеговы в России началось в 2017 году со стороны руководства России. 15 марта 2017 года министерство юстиции подало в Верховный Суд Российской Федерации иск о признании религиозной организации «Управленческий центр Свидетелей Иеговы в России» экстремистской, запрете её деятельности и ликвидацииВерховный суд рассмотрит иск о закрытии «Свидетелей Иеговы» 5 апреля // Российская газета. — 17.03.2017.. Основанием для иска послужила внеплановая проверка сотрудниками министерства соответствия деятельности религиозной организации её уставуВерховный суд РФ 5 апреля рассмотрит иск Минюста о запрете деятельности «Свидетелей Иеговы» . Интерфакс-Религия, 17.03.2017.. В тот же день первый заместитель министра юстиции Российской Федерации Сергей Герасимов выпустил распоряжение о приостановлении (до окончательного решения суда) деятельности (запрет на организацию и проведение собраний, митингов, демонстраций, шествий, пикетов и других массовых акций, запрет на использование вкладов в банках, кроме хозяйственной деятельности, покрытия убытков и оплаты сборов и штрафов) как головной, так и региональных организаций свидетелей Иеговы* «2. Религиозная организация „Управленческий центр Свидетелей Иеговы в России“ (распоряжение Министерства юстиции Российской Федерации от 15.03.2017 № 320-р „О приостановлении деятельности религиозной организации “).» — Перечень общественных и религиозных объединений, деятельность которых приостановлена в связи с осуществлением ими экстремистской деятельности . Официальный сайт Министерства юстиции Российской Федерации. О приостановлении деятельности религиозной организации «Управленческий центр Свидетелей Иеговы в России» . Официальный сайт Министерства юстиции Российской Федерации, 30.03.2017. «Религиозная организация „Управленческий центр Свидетелей Иеговы в России“ распоряжением Министерства юстиции Российской Федерации от 15.03.2017 № 320-р „О приостановлении деятельности религиозной организации“ добавлена в список общественных и религиозных организаций, деятельность которых приостановлена в связи с осуществлением ими экстремистской деятельности, следует из материалов сайта.» — Минюст приостановил деятельность «Свидетелей Иеговы» в России . Интерфакс, 23.03.2017.. 24 апреля 2017 года Замоскворецкий районный суд Москвы подтвердил законность данного распоряженияКленько Л. Суд отклонил иск «Свидетелей Иеговы» о незаконной приостановке деятельности . РАПСИ, 24.04.2017.Решение Замоскворецкого районного суда Москвы от 24.04.2017 по делу № 2а-297/2017.

Информационно-аналитический центр «Сова» отмечал, что 30 марта 2017 года 22 местные религиозные организации «свидетелей Иеговы» Крыма направили в Верховный суд РФ заявление, в котором просили в деле о запрете «Управленческого центра Свидетелей Иеговы в России» привлечь их к участию в качестве соответчикаОбщины Свидетелей Иеговы в Крыму хотят участвовать в процессе о запрете головной организации . Информационно-аналитический центр «Сова», 31.3.2017..

Иск о признании религиозной организации «Управленческий центр Свидетелей Иеговы в России» экстремистской, запрете её деятельности и ликвидации Верховный суд начал рассматривать 5 апреля 2017 годаВерховный суд объявил перерыв до четверга в рассмотрении иска о запрете в России «Свидетелей Иеговы» . Интерфакс-Религия, 05.04.2017.. Суд отклонил ходатайство представителей «свидетелей Иеговы» о приостановке рассмотрения иска министерства юстиции РФ до окончания процессов по ряду дел (в частности, о запрете деятельности восьми региональных отделений и о признании экстремистскими девяноста печатных изданий) в судах общей юрисдикции, поскольку «нахождение дел на рассмотрении судом общей юрисдикции не исключает возможности рассмотрения Верховным Судом искового заявления»Верховный суд РФ отклонил ходатайство «Свидетелей Иеговы» о приостановке производства по иску Минюста в отношении этой организации . Интерфакс-Религия, 05.04.2017.. Верховный суд РФ отказался привлечь по иску, ранее поданному «свидетелями Иеговы», в качестве соответчиков 395 представителей их региональных отделений. Кроме того, он отклонил ранее поданный «свидетелями Иеговы» встречный иск, в котором они просили признать их организацию «жертвой политических репрессий», поскольку Верховный суд посчитал, что «правила подсудности не предусматривают принятие встречного иска»ВС РФ отказался принять встречный иск «Свидетелей Иеговы» о признании их жертвами политических репрессий . Интерфакс-Религия, 05.04.2017.. Представитель министерства юстиции РФ на заседании Верховного суда официально заявила о намерении ведомства в случае удовлетворения иска добиться конфискации имущества религиозной организацииМинюст РФ намерен добиться от Верховного суда конфискации имущества «Свидетелей Иеговы» в случае запрета организации в стране . Интерфакс-Религия, 06.04.2017..

20 апреля 2017 года Верховный суд Российской Федерации признал экстремистской деятельность «Управленческого центра Свидетелей Иеговы в России», запретив его деятельность и деятельности всех 395 отделений на территории РоссииВерховный суд РФ ликвидировал российское отделение «Свидетелей Иеговы» . Интерфакс, 20.04.2017.. Имущество «Управленческого центра Свидетелей Иеговы» в России подлежит конфискации и обращению в пользу государства.. Представители «Управленческого центра Свидетелей Иеговы в России» Ярослав Сивульский и Сергей Черепанов заявили, что считают решение судьи Верховного суда Юрия Иваненко необъективным и намерены его обжаловать в Апелляционной коллегии Верховного суда РФ, а в случае его оставления без изменения — в ЕСПЧВерховный суд РФ признал «Свидетелей Иеговы» экстремистской организацией и ликвидировал её . ТАСС, 20.04.2017.. 17 июля 2017 года апелляционная жалоба «Управленческого центра Свидетелей Иеговы в России» на признание организации экстремистской, её ликвидацию и запрет деятельности на территории России была отклонена Верховным судом Российской Федерации*Верховный суд РФ не стал отменять ликвидацию «Свидетелей Иеговы» // Интерфакс, 17.07.2017 Верховный суд отклонил жалобу «Свидетелей Иеговы» на ликвидацию организации // Лента.ру, 17.07.2017 Верховный суд РФ признал законным запрет «Свидетелей Иеговы» // Мир, 17.07.2017 Верховный суд признал законной ликвидацию «Свидетелей Иеговы» // Газета.ру, 17.07.2017.

17 августа 2017 года Министерство юстиции Российской Федерации включило «Управленческий центр Свидетелей Иеговы в России» и его 395 местных религиозных организаций в список запрещённых в России организаций«Свидетели Иеговы» включены в список запрещённых в России организаций // Интерфакс-Религия, 17.08.2017.

Решение Верховного Суда обернулось десятками уголовных дел против свидетелей Иеговы. По состоянию на 9 июня 2020 года в списке «узников совести» на сайте российских «Свидетелей Иеговы» указаны 327 человек, которых преследуют в России.

Оценки Заместитель председателя Экспертного совета по проведению государственной религиоведческой экспертизы при Министерстве юстиции Российской Федерации, религиовед Роман Силантьев в экспертном комментарии для РИА Новости, выразив уверенность, что приостановление деятельности «Управленческого центра Свидетелей Иеговы в России» станет шагом к «признанию их деятельности экстремистской» и приведёт к полному запрету деятельности свидетелей Иеговы в России, указал, что имели место «случаи, когда их лишали статуса юрлица, как, например, в Москве».

отрицательно отнеслась к предложенному запрету и прокомментировала ситуацию для службы новостей «Forum 18»: «Российские власти утверждают, что свидетели Иеговы являются экстремистской группой, но в действительности экстремальным выглядит именно движение властей к их полному запрету».

Православный публицист Сергей Худиев в статье на портале «Православие и мир», считая, что свидетели Иеговы «люди, несомненно, заблуждающиеся», а их учение — «тяжёлая ересь», вместе с тем полагает, что их возможный запрет в России означает фактическое сворачивание свободы вероисповедания. По его мнению, приписать «экстремизм» Церкви можно ровно с тем же успехом, что и ереси. Размывание понятия «экстремизм» само по себе опасно, пишет Худиев, так как, по его словам, «если можно объявить „экстремистом“ человека, который и не помышляет ни о каких злодействах и мятежах, а просто имеет странные богословские воззрения, то само понятие „экстремизма“ становится универсальным кистенем, которым можно прибить кого угодно».

Корреспондент радиостанции «Голос Америки» Виктор Владимиров отмечает, что председатель независимого агентства правительства США , сенатор США Роджер Уикер, его сопредседатель конгрессмен США и член комиссии в связи с требованием российского Министерства юстиции в судебном порядке запретить религиозную деятельность свидетелей Иеговы в России на основании того, что они являются членами «экстремистской организации», выступили в совместным заявлением, где Уикер счёл недопустимым «применять несовершенное контртеррористическое законодательство против людей, которые хотят исповедовать свою веру», кроме того высказав мнение, что «российское правительство использует реальную угрозу насильственного экстремизма, чтобы окончательно уничтожить последние остатки свободы совести в стране» и отметив, что «это отвлекает от реальной борьбы с терроризмом».

На официальном сайте Американского мемориального музея Холокоста была «выражена глубокая тревога в связи с сообщениями о притеснениях свидетелей Иеговы в России и желанием российского Минюста запретить эту религию из-за участия её членов в „экстремистской деятельности“». Директор музея отметила, что «Холокост учит нас опасностям государственного покровительства в деле назначения любой группы в качестве цели для удара», и добавила, что «хотя то, что происходит в России, нисколько не сравнимо с нацистской Германией, важно помнить, что нацистская партия воспринимала свидетелей Иеговы как угрозу государству и подвергала их сильному преследованию».

Представитель психолог в интервью для Deutsche Welle сказал, что притязание свидетелей Иеговы «на роль единственной истинной христианской организации в мире» весьма несовременно «для общества, стремящегося к диалогу культур». При этом Утш высказал мнение, что свидетели Иеговы «миролюбивы, отказываются брать в руки оружие, проповедуют любовь к ближнему, воспринимают взаимопомощь как основу жизни в общине, делают пожертвования». Исходя из этого он считает, что «к экстремизму всё это не имеет никакого отношения», а запрет свидетелей Иеговы в России, по его словам, является признанием руководства страны «в неспособности обеспечить соблюдение основных прав человека».

Пресс-секретарём Европейской службы внешних дел, в связи с признанием действительным запрета деятельности свидетелей Иеговы в России, было сделано заявление, в котором говорится, что «этот запрет уже привёл к уголовному преследованию свидетелей Иеговы, а также к проведению полицейских облав в местах богослужения, умышленным поджогам и другим формам притеснения».

Реакция В 2002 г. в издании «НГ-Религии» доктор юридических наук Л. С. Симкин в своём обзоре составленного историком М. И. Одинцовым сборника документов по операции «Север» и других материалов о свидетелях Иеговы в Советском Союзе отметил актуальность проблемы религиозного экстремизма, но допустил вероятность того, что «чиновники, причастные к государственно-церковным отношениям», подключатся «наравне с иными ведомствами к поиску экстремистов» и станут «искать их среди тех же „сектантов“», которые «в отличие от настоящих экстремистов всегда на виду», и с доктриной которых «легко ознакомиться, а ознакомившись, выискивать крамолу».

14 февраля 2012 года Европейский парламент выразил «глубокую озабоченность в отношении неправильного использования антиэкстремистского законодательства» в отношении свидетелей Иеговы и «неуместного запрета их материалов в качестве экстремистских».