21 октября 1993 года группа бурундийских офицеров с преобладанием тутси предприняла попытку государственного переворота, в ходе которой убила президента-хуту Мельхиора Ндадайе и ряд других должностных лиц, которые, согласно конституции, должны были занять пост президента в случае его кончины. В качестве нового президента военные представили , но из-за международного давления результаты переворота были аннулированы, а во главе страны встала премьер-министр из тутси Сильви Киниги.

К 1990 году республика Бурунди находилась под длительным правлением военных из числа тутси, которое продолжалось с независимости страны в 1960-х годах. В 1987 году к власти пришёл Пьер Буйоя, который изначально следовал политике предшественников, однако в дальнейшем отказался от неё и передал бразды правления демократически избранному правительству во главе с Мельхиолором Ндадайе. Это привело к возвращению в страну тысяч беженцев-хуту, которые ранее пытались спастись от этнического насилия. Правительство пересмотрело ряд договоров и начало реформу армии, что угрожало богатой верхушке страны и офицерам. Из-за этого они приняли решение вернуть власть в свои руки.

21 октября рано утром путчисты окружили президентский дворец. Они расправились с несколькими политиками и родственниками президента, а затем обнаружили и убили его самого. Сразу после этого военачальники организовали «Комитет по преодолению политического кризиса» и стали писать в посольства и международные организации, требуя признания нового режима и уверяя в том, что переворот был вызван безысходностью положения. Однако мировое сообщество подвергло его широкому осуждению, и 25 октября, в результате политической борьбы в стране самый высокопоставленный чиновник — премьер-министр из тутси Сильви Киниги — взяла на себя роль временного президента и вскоре передала бразды правления новому демократическому правительству.

Данный переворот, который ряд политологов и историков называют «самой удачной из провальных попыток переворота в Африке», привёл к обострению этнического насилия, что вылилось в резню и погромы, а также в долгую гражданскую войну.

Предыстория С середины 1960 в получившем независимость от Бельгии государстве Бурунди политическую верхушку заняли члены народности тутси, которые являются национальным меньшинством в стране, где большинство населения представлено хуту. В 1966 году правительство ввело однопартийную систему, в которой единственно законной стала партия «Союз за национальный прогресс» (), которая в большинстве своём состояла из тутси. На посту президента один за другим друг друга сменяли военные, приходя к власти в результате государственных переворотов. В эти годы имели место случаи массовых репрессий на национальной почве, наиболее крупная серия которых произошла в 1972 году, когда армия Бурунди подавила восстание хуту и в отместку расправилась с тысячами мирных жителей.

В 1987 году произошёл очередной военный переворот, по результатам которого президентом страны был назначен тутси Пьер Буйоя. Первоначально он следовал политике своих предшественников и игнорировал распри в стране, сохраняя доминирование тутси в общественной жизни. В августе 1988 года, во время вспышки беспорядков и националистического насилия бурундийская армия вновь убила тысячи хуту. Это событие вызвало давление на правительство Буйои со стороны мирового сообщества, из-за чего ему пришлось пойти на уступки и начать реформы с целью положить конец этническому насилию в стране. Под руководством президента национальный состав UPRONA стал более разнообразным, среди членов партии увеличилось количество хуту. Истеблишмент тутси в армии и силах безопасности, тем не менее, сопротивлялся переменам. Несмотря на это Буйоя разработал новую конституцию, которая предусматривала переход к многопартийности и первые демократические выборы в стране. В марте 1992 года состоялся референдум, на котором большинство населения высказалось за принятие новой версии основного закона. После этого события началось формирование новых политических партий. Буйоя решил принять участие в грядущих выборах от партии UPRONA. Его основным соперником стал лидер «Фронта за демократию в Бурунди» () Мельхиор Ндадайе. Его партия состояла в основном из хуту и рассчитывала на голоса национального большинства. На состоявшихся в 1993 году выборах FRODEBU одержала решительную победу. Ндадайе получил 64 % голосов избирателей на выборах президента, а на парламентских выборах «Фронт» получил 71,4 % голосов и 80 % мест в Национальной ассамблее, сформировав конституционное большинство. Члены партии одержали победу на многих региональных и местных муниципальных выборах, получив контроль над значительным количеством городских и провинциальных администраций, которые ранее удерживали тутси из UPRONA.

После победы FRODEBU в Бурунди ходили слухи о том, что армия может вмешаться и попытаться сорвать транзит власти. В ответ на высказанные опасения Ндадайе заверил своего сторонника, что «они могут убить одного Ндадайе, но они не убьют пять миллионов Ндадайе». Небольшая группа офицеров действительно устроила заговор, однако он провалился из-за отсутствия весомой поддержки в вооружённых силах. После этого солдаты арестовали несколько человек, включая предполагаемого лидера заговора, подполковника Сильвестер Нингаба, который был начальником кабинета Буйои. Буйоя при этом согласился с поражением, призывал население страны принять результаты выборов и осудил попытку переворота и военное руководство, которое не смогло найти и обезвредить группировку. 10 июля состоялась присяга президента Ндадайе. Он сформировал коалиционное правительство, где из 23 человек большинство — 13 — принадлежало к его партии, шестеро — к UPRONA, а остальные 4 места достались членам других политических групп. 9 из этих министров принадлежали к народности тутси, включая одного из членов UPRONA Сильви Киниги, которая заняла пост премьер-министра страны.

В во время правления Ндадайе в республике установился хрупкий мир. Несмотря на это, в 1993 году в Бурунди произошли два серьёзных политических потрясения. Первоначально недавно получившие относительную свободу благодаря либерализации средства массовой информации часто использовали её с целью резкого обсуждения государственных проблем, подстрекая народ к новым беспорядкам. Второй проблемой стало возвращение беженцев-хуту, которые покинули страну в 1972 году и теперь требовали возвращения своей собственности. И хотя Ндадайе предложил им заселиться на свободных землях, многие местные правители проигнорировали его решение и передали дома на своей территории в распоряжение беженцев, выселив их обитателей. В политическом плане новое правительство пересмотрело и отменило ряд уступок, совершённых правительством Буйои, что создало угрозу для деловых интересов элиты тутси. Ндадайе не ограничился реформами в политической и социальной сфере, проведя их и в армии, где командование жандармерии было отделено от командования армии, а начальники штабов обоих подразделений были уволены и заменены новыми. Тогда же были введены новые требования к желающим служить по контракту. На ноябрь был назначен всеобщий призыв, что могло привести к резкому увеличению числа хуту в армии. Некоторые офицеры и солдаты армии из числа тутси опасались, что это приведёт к утере занимаемого ими доминирующего положения в армии.

Организаторы переворота К концу 1993 года ситуация в армии накалилась до предела, и ряд высокопоставленных офицеров приступил к разработке плана нового государственного переворота. По словам офицера президентской гвардии, одной из наиболее важных мер, предпринятых заговорщиками, стала переброска войск из других мест дислокации в столицу Бурунди Бужумбуру для увеличения численности доступных сил. Согласно журналисту Алексису Сундихиге, путчисты полагались на капрала Нзисабиру как на информатора в президентской гвардии.

Точная личность организаторов переворота 1993 года остаётся неизвестной, и в научной среде существует немало споров на этот счёт. Основными участника специалисты обычно называют начальника Генерального штаба подполковника , экс-президента Жан-Батиста Багазу и бывшего министра внутренних дел Франсуа Нгезе. Первые два позже отрицали свою причастность, в то время как третий заявлял, что его заставили поддержать путч. Среди других лиц, которые считаются ключевыми участниками попытки переворота — подполковник Нингабу, подполковник Шарль Казатасу, подполковник Лоран Нийонкуру и майор Бернар Бусокоза. Некоторые правозащитные группы заявляли, что экс-президент Буйоя мог поддерживать путчистов, хоть и не участвовал в перевороте напрямую. Среди открыто признавших своё участие в заговоре — два молодых офицера, лейтенант Жан-Поль Камана и комендант Илер Нтакиика. Они вместе с американским дипломатом и политологом Бобом Крюгером считали Буйою главным среди заговорщиков. Среди других подозреваемых в участии в заговоре — Жером Синдухидже, , Либер Бараруньестсе, Паскаль Симбандуку, подполковник Жан-Боско Дарадангве, Франсуа Бизиндави, Самюэль Ндувингома, Лоран Нийонкуру, политик UPRONA Шарль Мукаси, подполковник Нзосаба, подполковник Ндайисаба, подполковник Ниоюнгуруза, подполковник Марегареге, подполковник Ненгери, подполковник Панкрас Гируквигомба, майор Жерве Нимубона, майор Букаса, майор Хазио, лейтенант Нтаратаза, лейтенант Нгомиракиза, Винсан Ниюнгеко и Жорже Мукарако. Какую роль сыграли (и сыграли ли вообще) в организации переворота иностранные силы неизвестно.

За день до начала переворота С 16 по 18 октября 1993 года Ндадайе участвовал в саммите глав франкофонских государств на Маврикии. В последний день он покинул переговоры и вернулся в Бурунди. В это время начальник Генерального штаба жандармерии подполковник Эпитас Баяганаканди сообщил министру обороны подполковнику Шарлю Нтакидже о том, что у него есть достоверные сведения, которые указывают на организацию в стране очередного военного переворота. 19 октября офицер связи подошёл к жене министра связи и сообщил ей, что сотрудники штаба армии готовят заговор против президента. 20 октября в 3 часа дня по местному времени (UTC+2) майор Исайе Нибизи, командир 2-го батальона коммандос, комендант лагеря «Муха» и офицер, ответственный за безопасность президента сообщил руководителю министерского кабинета Ндадайи о «подозрительных движениях среди военных».

Во второй половине дня Ндадайе собрал в Бужумбуре свой кабинет министров. Они отмечали 100 дней президентства, которые прошли 16 октября, и обсуждали, что именно добилось правительство из предвыборной программы, а что ещё предстоит сделать. После заседания министр связи Нгендахайо попросил президента о личной беседе, во время которой выразил беспокойство за его безопасность. Но вместо того, чтобы рассказать о фактах о неизвестного происхождения угрозе, что ему рассказала супруга. Он заявил о том, что ему кажется странным поведение оппозиционеров из UPRONA, которые осуждали их стратегию по возвращению в страну беженцев, хотя большинство из них вероятно предпочло проголосовать на грядущих в декабре выборах именно за состоящую из тутси UPRONA. По его словам, беженцы знают об этом, и это наверняка будет стоить им многих голосов и победы на выборах. Поэтому Нгендахайо сделал вывод, что единственная причина такого поведения может заключаться в планировании государственного переворота. Помимо этого министр попросил Ндадайе провести дополнительное рассмотрение недавнего отчёта, в котором он поставил под сомнения безопасность и надёжность охраны президента. Тогда Ндадайе поручил привести к нему министра обороны страны Шарля Нтакидже. Нгендахайо направился за ним и нашёл министра в отдельной комнате, когда тот разговаривал по телефону. Посол Мельхиор Нтамобва, который присутствовал при этом разговоре заявил, что Нтакидже сообщили о готовящемся государственном перевороте, который должен произойти текущей ночью. Как только Нтакидже закончил разговор, он и Нгендахайо отправились в кабинет президента.