náhľad|Fázová a antigénna variácia v baktériách. pA je promotor pre FimA, pB je promotor pre FimB a pE je promotor pre FimE. IRR je invertovaná repetícia vpravo a IRL je invertovaná repetícia vľavo. FimB a FimE sú rekombinázy, ktoré dokážu zmeniť orientáciu promotora FimA invertovaním IRR a IRL.Konzervatívna miestne špecifická rekombinácia je typ nehomologickej rekombinácie, ktorý nevyužíva transpozóny ako mobilné genetické elementy. Nejedná sa o transpozíciu. Konzervatívna miestne špecifická rekombinácia vyžaduje špecifické DNA sekvencie na donornej a akceptornej DNA, ktoré sú rozpoznávané rekombinázou, čo je enzým podobný topoizomerázam v tom zmysle, že tvoria prechodné vysokoenergetické kovalentné väzby proteín-DNA, pričom energiu využívajú na prešmyk DNA, pričom všetky fosfodiesterové väzby, ktoré boli v priebehu reakcie prerušené, sú na konci obnovené (preto "konzervatívna " miestne špecifická rekombinácia).
Porovnanie transpozície a konzervatívnej miestne špecifickej rekombinácie +TranspozíciaKonzervatívna miestne špecifická rekombináciaMobilné genetické elementyTranspozón (transponovateľný element), DNA transpozón, Neretrovirálny retrotranspozón, Retrovírusu podobný retrotranspozóncyklická dvojreťazcová DNASelektivita náhodné vnorenie DNA sekvencievyžaduje špecializované DNA sekvencieEnzýmytransponáza, reverzná transkriptáza, integráza, endonukleázarekombinázaReakčný mechanizmusŽiadne kovalentné väzby medzi DNA a proteínom, proces zanecháva medzery v jednom vlákne DNA, ktoré musí doplniť DNA polymerázaTvorba vysokoenergetického intermediátu, kde sú kovalentne prepojený enzým rekombináza a DNA
Referencie
Pozri aj mobilný genetický element transpozícia fázová variácia
Kategória:Molekulárna biológia Kategória:Biotechnológia