Hamnskär kan syfta på följande platser:
Finland
Hamnskär, Björneborg, Satakunta, Hamnskär (vid Brunskär, Korpo), Åboland, Hamnskär (vid Utö, Korpo), Åboland, Hamnskär, Nagu, Åboland, Hamnskär, Kimitoön, Åboland, Hamnskär (vid Gunnarsörarna, Hangö), Nyland, Hamnskär (vid Tvärminne, Hangö), Nyland, Hamnskär, Lovisa, Nyland,
Åland
Hamnskär, en ö i Rannörarna, Hamnskär (Saltvik, Åland), ö, Hamnskär (sydost Föglö, Åland), ö, Hamnskär (sydväst Föglö, Åland), ö, Hamnskär (Kökar, Åland), ö, Hamnskär (Vårdö, Åland), ö, Hamnskär (Brändö, Åland), öar, Hamnskär (norra Hammarland, Åland), ö, Hamnskär (västra Hammarland, Åland), ö, Hamnskär, del av Orrskär, Eckerö, ö,
Sverige
Hamnskär, Värmdö kommun, en ö utanför Nämdö i Stockholms län,
Se även HMS Hamnskär (76) – en svensk bevakningsbåt Hamneskär Hamnskäret Hamskeri Lilla Hamnskär Stora Hamnskär