Bottensjön kan syfta på ett antal insjöar i Sverige:
Bottensjön, Västergötland, sjö i Karlsborgs kommun, (12,1 km²) Bottensjön, Dalsland, sjö i Bengtsfors kommun och Dals-Eds kommun, (99,7 ha) Bottensjön, Lappland, sjö i Lycksele kommun, (13,2 ha)
Kategori:Listor över Sveriges insjöar baserat på namn