Mnich 21 marca 1884, w dniu obchodzonym przez benedyktynów jako święto św. Benedykta, założyciela zakonu benedyktyńskiego, Luigi Caruana został przyjęty jako postulant wspólnoty monastycznej, i 11 września tego roku przyjął habit zakonny i otrzymał przy tej okazji imię zakonne Maurus, na cześć jednego z najsłynniejszych uczniów założyciela zakonu. 11 listopada 1885 złożył czasowe śluby zakonne, a trzy lata później, 11 listopada 1888 śluby uroczyste. Następnie kontynuował studia teologiczne i 14 marca 1891 przyjął święcenia kapłańskie na księdza katolickiego z rąk , biskupa Aberdeen. Następnie został wysłany na studia kościelne do Rzymu w San Anselmo College, międzynarodowym ośrodku studiów prowadzonym przez zakon Benedyktynów.
Po powrocie do opactwa Caruana wykładał filozofię, teologię i literaturę łacińską w szkole klasztornej. W 1899 został mianowany proboszczem parafii w Dornie, w zachodnim Ross-shire, w Highlands, gdzie nauczył się gaelickiego, aby opiekować się rozproszonymi parafianami. W 1904, ze względu na swój talent i wykształcenie, został wybrany na prywatnego sekretarza biskupa Ambrose Agiusa OSB (1856–1911), również mnicha benedyktyńskiego, który w tym czasie był delegatem apostolskim na Filipinach.