Jednak ze względu na niewielką liczbę członków gminy, a także ich niezamożność, budowa nowego miejsca modlitwy była początkowo niemożliwa.
W 2009 roku otwarto w Duszanbe nową synagogęNew synagogue of Dushanbe to open soon.. Budowa została sfinansowana m.in. przez tadżyckiego biznesmena Hasana Assadullozoda.
Kontrowersje wokół zburzenia synagogi thumb|200px|Wejście do synagogi
Zburzenie synagogi odbiło się szerokim echem na całym świecie i wywołało wiele kontrowersji, głównie w środowisku żydowskim. Jak stwierdził Sahmsuddin Nuriddinow, szef departamentu stosunków religijnych gminnej administracji Duszanbe, budynek nie posiadał żadnej historycznej wartości. Dodał również, że nie mógłby wejść w skład kompleksu Pałacu Narodów, ze względu na swój nieestetyczny wygląd oraz niestosowność faktu, aby synagoga stała obok pałacu prezydenckiego. Zaznaczył, że nie widzi sposobu, aby włączyć ją do planu odbudowy. Rabin synagogi Michail Abdurakhmanov oświadczył, że władze mogłyby się spotkać z Żydami, wysłuchać naszych racji, zamiast burzyć jedyną synagogę w kraju.