Po klęsce Napoleona W lipcu 1814 Puchalski przybył do Poznania, w tym samym roku został przewodniczącym komisji, mającej egzaminować wszystkich urzędników zdrowia armii polskiej. W 1816 Puchalski wziął dymisję z armii Królestwa Polskiego i osiadł w Kaliszu. Tam nabył dom o pałacowej architekturze, zbudowany około roku 1820 lub w latach 1828/1829, według projektu Sylwestra Szpilowskiego lub Franciszka Reinsteina (obecnie przy placu Kilińskiego).
W 1828 Puchalski od rodziny generała Umińskiego kupił podkaliski majątek Zakrzyn.
Józef Grzegorz Puchalski zmarł 5 marca 1833 w Kaliszu i został pochowany na tamtejszym cmentarzu katolickim. Zachowała się kamienna nagrobna tablica inskrypcyjna, jedna z najstarszych na cmentarzu.
Po śmierci Puchalskiego wdowa po nim dała ogłoszenie o sprzedaży pałacu wraz z zapleczem gospodarskim, wozownią, stajnią i ogrodami. Pałac nabył kaliski Żyd o nazwisku Puławski (stąd niekiedy dwojaka nazwa: pałac Puchalskich lub pałac Puławskich).